Хорошая физическая подготовка для таможенников является немаловажным условием для успешного выполнения служебных обязанностей. Поэтому Центральное таможенное управление тщательно следит за физическим развитием своих сотрудников. С целью популяризации здорового образа жизни среди должностных лиц таможенных органов, создания условий для укрепления здоровья средствами физической культуры и спорта, а также повышения уровня специальной и физической подготовки ежегодно проводятся различные спортивные мероприятия: Спартакиада таможенных органов Управления, Чемпионат по лыжным гонкам; Кубок Управления по служебному двоеборью; Чемпионат по мини-футболу; Чемпионат по стрельбе из боевого ручного стрелкового оружия.
Так же представители Центрального таможенного управления принимали участие и обеспечивали проведение Чемпионатов таможенных органов Российской Федерации по служебному летнему и зимнему двоеборью, а также по стрельбе из боевого ручного стрелкового оружия. В Чемпионате по служебному двоеборью сборная команда Управления заняла 3 общекомандное место, а на Чемпионате по стрельбе из боевого оружия – 2 общекомандное место.